比萨圣安娜大学的前身，最早可以追溯到16世纪的费迪南多一世学院（Collegio Ferdinando I）。此外，该校还与建立于17世纪的普特阿诺学院（Collegio Puteano）和康维特青年教育学校（Scuola Convitto Per L'Educazione Delle Giovani）有着深厚的历史渊源。

成立于上世纪40年代末的比萨高等师范学校的医学和法律部门，于1967年转变为比萨大学的高等研究中心（Scuola Superiore di Studi Universitari e di Perfezionamento）。并最终由1987年2月14日第41条意大利国家法律规定，正式成立了比萨圣安娜大学。比萨圣安娜大学（意大利文：Scuola Superiore di Studi Universitari e di Perfezionamento Sant'Anna，缩写SSSUP；英文：Sant'Anna School of Advanced Studies），又译意大利圣安娜高等研究学院，是一所欧洲享有盛誉的精英学院，位于意大利历史文化名城比萨市，其前身可上溯至16世纪。学校规模很小，然而却在科学研究方面走在意大利乃至世界的最前列。该校政治学，法学，经济学，管理学，工程学，计算机学等均位于意大利前列。圣安娜高等研究学院（SSSUP）与意大利的里雅斯特国际高等研究院（SISSA）、比萨高等师范学院（SNS）是在意大利齐名的三所精英大学和意大利高级指导性学术研究中心，与比萨高等师范学院和比萨大学组成比萨大学系统，与比萨高等师范学院和帕维亚高等研究院组成意大利大学校（法语：Grandes Écoles）联盟。该校现有1652名学生，其中本科生232名，博士生342名。